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Juno Eclipse è nata su Corulag dove, per volere del padre, frequentò l' Accademia Imperiale. Divenne un pilota decorato, distinguendosi in più di cento missioni durante la Grande Purga Jedi. Promossa al grado di Capitano, le fu affidato il comando delle operazioni durante il Bombardamento di Callos. Gli ordini erano di devastare il pianeta e lei eseguì alla lettera. E' in questa occasione che Juno cominciò a dubitare dell' Impero.

In seguito venne assegnata al Death Squadron di Darth Fener, dove divenne il primo ufficiale della flotta e, subito dopo, anche unica responsabile di un nuovo progetto top secret: il suo compito consisteva nella manutenzione e nella guida della Rogue Shadow, nave di trasporto di Galen Marek, apprendista segreto di Darth Fener. Dopo essere stata accusata di tradimento dall'Impero, venne imprigionata sulla Empirical, la nave scientifica della flotta di Darth Fener, dove venne salvata dallo stesso Marek. Quind aiutò Marek nella creazione dell'Alleanza Ribelle.

Durante le loro avventure Juno e Galen si innamorarono, ma la loro storia ebba vita breve, poichèil giovane fidanzato morì durante un duello con le spade laser contro l'Imperatore. Juno Eclipse fu in seguito presente alla fondazione dell'Alleanza per la Restaurazione della Repubblica, su Kashyyyk, e diventò un pilota dell'Alleanza Ribelle. In seguito riuscì a rintracciare il droide PROXY, con l'aiuto di Bail Organa, e lo rimise in funzione. Comandònel contempo la parte della flotta ribelle dislocata nell' Orlo Esterno. Nell' 1 BBY, dopo la fuga del clone di Starkiller dalla prigione imperiale di Kamino, Darth Fener ingaggiò il famoso cacciatore di taglie Boba Fett per catturarla, mentre si trovava a bordo della nave ribelle Salvation, e per usarla come esca per attirare il clone di Starkiller-Marek. La donna venne quindi condotta con la forza su Kamino, dove poco dopo fu salvata dallo stesso clone di Starkiller, giunto insieme alla flotta ribelle. Dopo la conquista di Timira City, Fener venne arrestato e Juno Eclipse pilotò la Rogue Shadow per condurlo nel luogo dove sarebbe stato processato. Sfortunatamente Boba Fett intervenne con la sua nave, la Slave I, e liberò il Sith da morte certa.

Successivamente Juno Eclipse e Galen Marek fuggirono nell'Orlo Esterno, lontano dalla ribellione e dall'Impero, e vissero una lunga vita assieme dimenticati dalla Galassia.